Từ năm 1995 đến nay cán bộ khoa học của Viện Môi trường và Môi trường Phát triển Bền vững đã phối hợp với nhiều đơn vị KH-CN thực hiện công tác quan trắc (monitoring) về môi trường như sau:
- Quan trắc môi trường Dự án WB “Nâng cấp 2 tuyến đường thủy phía Nam và Cảng Cần Thơ: từ TP Hồ Chí Minh đi Cà Mau và Hà Tiên” (quan trắc thủy hóa, bùn đáy, thủy sinh…), 2000-2005.
- Quan trắc môi trường Trung tâm Điện lực Phú Mỹ, bao gồm cả sông Thị Vải (thủy hóa, thủy sinh), 2003 -2006.
- Quan trắc môi trường Dự án Trung tâm Nhiệt điện Phú Mỹ (quan trắc ô nhiễm không khí, nước), 2004 đến nay.
- Quan trắc môi trường Dự án Nhà ga Quốc tế sân bay Quốc tế Tân Sơn Nhất (Dự án JBIC), (ô nhiễm không khí, ồn, rung), 2004-2007.
- Quan trắc chất lượng nước Dự án WB “Bảo vệ và phát triển các vùng đất ngập nước ở Việt Nam”, 2005-2006.
- Quan trắc môi trường Dự án Nhà ga T2 Cảng Hàng không Quốc tế Nội Bài (JICA), 2010-2013.
- Quan trắc môi trường Dự án Nhà máy Nhiệt điện Mông Dương II (TAISEI), 2011-2013.
- Giám sát môi trường giai đoạn thi công các dự án Cảng hàng không Pleiku, (2015).
- Giám sát môi trường giai đoạn thi công Dự án “Nhà ga hành khách – Cảng hàng không Thọ Xuân” (2015).
- Giám sát môi trường giai đoạn thi công Dự án “Nhà ga hành khách – Cảng hàng không Quốc tế Cát Bi” (2015).
- Lập Kế hoạch Giám sát môi trường cho Đề án bảo vệ môi trường chi tiết Cảng hàng không Rạch Giá – năm 2015.
- Kế hoạch Bảo vệ môi trường và giám sát môi trường định kỳ cho các dự án sân bay trong cả nước: Nội Bài, Tân Sơn Nhất, Phú Quốc, Côn Đảo, Cát Bi, Thọ Xuân, Pleiku, …. (hàng năm từ 2010 đến nay).
- Quan trắc môi trường Trang trại nông lâm sinh thái bền vững, thuộc Công ty Cổ phần đầu tư lương thực và thực phầm ngành ong, 2012 – nay.